امروزه نظام اطلاعات مناسب، ابزاری مهم برای مديريت و تصميمگيری در همه سازمانها از جمله نظام سلامت كشور محسوب می شود.داشتن اطلاعات به هنگام و معتبر كه در يك نظام مستمر جمعآوری میشود، ضمن اينكه عمليات جاری سازمان را تسهيل و تسريع ميكند، توانايی و مداخلات مديريتی و حل مشكلات سازمانی را نيز فراهم میسازد. نظام اطلاعات جاری سلامت يكی از مهمترين منابع اطلاعات سلامت است و مهمترين اهدافی كه در اين نظام توسط گروه آمار معاونت بهداشتی دنبال می شود،
عبارتند از:
امکان دسترسی آسان به اطلاعات در تصمیمگیریهای نظام مراقبت بهداشتی
ترویج بکارگیری پژوهشهای کاربردی در حل مشکلات سلامت
بکارگیری فناوری نوین اطلاعات در مدیریت اطلاعات سلامت
توانمندسازی مدیران و کارشناسان در عرصه نظام سلامت
ارتقاي كيفيت آمارها و شاخصهاي سلامت